TRANSFAC數(shù)據(jù)庫是關于轉(zhuǎn)錄因子、它們在基因組上的結(jié)合位點和與DNA結(jié)合的profiles的數(shù)據(jù)庫。由SITE、GENE、FACTOR、CLASS、MATRIX、CELLS、METHOD和REFERENCE等數(shù)據(jù)表構成。此外，還有幾個與TRANSFAC密切相關的擴展庫：PATHODB庫收集了可能導致病態(tài)的突變的轉(zhuǎn)錄因子和結(jié)合位點；S/MART DB收集了與染色體結(jié)構變化相關的蛋白因子和位點的信息；TRANSPATH庫用于描述與轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控相關的信號傳遞的網(wǎng)絡；CYTOMER庫表現(xiàn)了人類轉(zhuǎn)錄因子在各個器官、細胞類型、生理系統(tǒng)和發(fā)育時期的表達狀況。TRANSFAC及其相關數(shù)據(jù)庫可以免費下載，也可以通過Web進行檢索和查詢。