比較項(xiàng)目 |
化學(xué)合成 |
體外轉(zhuǎn)錄 |
RNase III降解dsRNA |
siRNA |
PCR |
材料需求 |
21-mer RNA |
29-mer DNA oligos(一對(duì)) |
轉(zhuǎn)錄模版 (200-1000bp,兩側(cè)帶T7 啟動(dòng)子) |
55-60-mer DNA oligos(一對(duì)) |
~50-mer DNA oligos(一對(duì)) |
全部制備/合成時(shí)間所需時(shí)間 |
4天—2周 |
24 小時(shí) DNA oligo合成時(shí)間 |
1 天 轉(zhuǎn)錄模版制備時(shí)間 |
5天以上 DNA oligo合成時(shí)間 |
~ 6 小時(shí) DNA oligo合成時(shí)間 |
個(gè)人所需操作時(shí)間 |
幾乎不需要* |
中等 |
中等 |
多 |
中等 |
是否需要驗(yàn)證和尋找最有效siRNA |
需要 |
需要 |
不需要 |
需要 |
需要 |
能否標(biāo)記siRNA (例如用于熒光顯微鏡分析siRNA進(jìn)入細(xì)胞過程或者在細(xì)胞中的定位) |
能 |
能 |
能 |
不能 |
不能 |
轉(zhuǎn)染的相對(duì)難易程度 |
好 |
好 |
好 |
差 |
差 |
可篩選性 (例如抗生素篩選) |
不可以 |
不可以 |
不可以 |
可以 |
不可以 |
能否用于長效抑制 |
不可以 |
不可以 |
不可以 |
可以(抗生素篩選) |
不可以 |
能否大規(guī)模制備 |
可以 |
有限 |
有限 |
可以 |
有限 |
檢測總體轉(zhuǎn)染效率 |
不可以 |
不可以 |
不可以 |
可以 |
不可以 |
每個(gè)基因的相對(duì)費(fèi)用(不包含人力) |
高 |
中等 |
低 |
中等 |
中等 |
*取決于合成后是否包含純化、去保護(hù),以及廠家提供的是已經(jīng)退火的即用型雙鏈還是凍干的單鏈 |