可以提供各種營養(yǎng)元素。化肥中只含有一種或幾種營養(yǎng)元素，長期單一施用化肥，稻田中的某種營養(yǎng)元素被大量取走卻得不到及時補充，會造成水稻某些營養(yǎng)元素嚴重缺乏，出現(xiàn)缺素癥狀和各種病害。而有機肥養(yǎng)分齊全，肥效穩(wěn)而長，施用于稻田，能防止缺素、早衰和脫肥等現(xiàn)象。

有利于改良培肥土壤長期單一施用化肥，會造成稻田腐殖質(zhì)含量逐年下降，土壤團粒結(jié)構(gòu)受到破壞，土壤板結(jié)，土薄地瘦、蓄水保肥能力降低。而施用有機肥后，在微生物的作用下，一方面礦質(zhì)化為作物吸收的營養(yǎng)元素，另一方面腐殖化為腐殖質(zhì)，改善土壤的物理性狀，調(diào)節(jié)土壤水、肥、氣、熱狀況，使土壤疏松易耕，變瘦土為肥土，變壞土為好土。

有利于改良低洼冷浸田。冷浸田潛育型稻田廣泛分布于沖垅谷地、庫塘下部、平原和湖區(qū)的低洼地帶。這些稻田施入腐熟的有機肥料，可以提高土壤的抗逆性，有利于降低土壤容重，改善土壤結(jié)構(gòu)，提高土壤保蓄水肥的能力。同時還能提高土溫，促使水稻早生快發(fā)，提早返青分蘗，防止僵苗的發(fā)生。

促使土壤微生物繁衍，提高化學肥料的利用率。施用有機肥后，有機質(zhì)腐解能為土壤微生物的生命活動提供所需要的能量和養(yǎng)料；反過來，微生物活動加速了有機質(zhì)的分解，可以改良土壤結(jié)構(gòu)，增加土壤有機質(zhì)的含量，豐富土壤養(yǎng)分，提高土壤肥力。有機肥在分解的過程中，能放出大量二氧化碳，并產(chǎn)生有機酸等物質(zhì)。由于二氧化碳濃度的提高，進一步滿足了作物光合作用的需要。產(chǎn)生的有機酸，又能使土壤中原來難溶性的無機礦物鹽類和難溶性肥料加速轉(zhuǎn)化，變?yōu)槟鼙蛔魑镂�收的營養(yǎng)，提高了土壤中原有養(yǎng)分的有效性。土壤對有機肥中磷的固定較小，而且有機肥中的磷50%~60%是水溶性或檸檬酸溶性的，可與化學肥料中的磷互相溶解，加速吸收。長期的生產(chǎn)實踐證明，土壤肥力與作物產(chǎn)量有著密切的關系。高肥力土壤上的作物光能利用率，比低肥力土壤高15~30倍；高肥力土壤上種植的作物比低肥力土壤早熟5~10天；高肥力土壤上作物產(chǎn)量可較低肥力土壤高50%~100%。所以大量增施有機肥料，保持和提高土壤肥力，對提高糧食產(chǎn)量和降低生產(chǎn)成本，具有極其重要的作用。

一些施用肥料較多、農(nóng)業(yè)生產(chǎn)比較發(fā)達的國家，如美國、日本、德國、荷蘭等，也都十分重視有機肥料的施用。在提倡生態(tài)農(nóng)業(yè)的今天，更應該千方百計地積制和利用有機肥料，如收集以人畜糞尿為主的農(nóng)家肥，大力發(fā)展綠肥，大搞農(nóng)作物秸稈還田，推廣使用沼氣渣肥等，是發(fā)展現(xiàn)代農(nóng)業(yè)，增強農(nóng)業(yè)后勁，增加糧食產(chǎn)量的重要戰(zhàn)略措施。