在任何化學(xué)反應(yīng)中，反應(yīng)物分子必須超過一定的能閾，成為活化的狀態(tài)，才能發(fā)生變化，形成產(chǎn)物。這種提高低能分子達(dá)到活化狀態(tài)的能量，稱為活化能。催化劑的作用，主要是降低反應(yīng)所需的活化能，以致相同的能量能使更多的分子活化，從而加速反應(yīng)的進(jìn)行。

　　酶能顯著地降低活化能，故能表現(xiàn)為高度的催化效率。例如前述的H2O2酶的例子，可以顯著地看出，酶能降低反應(yīng)活化能，使反應(yīng)速度增高千百萬倍以上。

　　二、中間復(fù)合物學(xué)說

　　目前一般認(rèn)為，酶催化某一反應(yīng)時(shí)，首先在酶的活性中心與底物結(jié)合生成酶－底物復(fù)合物，此復(fù)合物再進(jìn)行分解而釋放出酶，同時(shí)生成一種或數(shù)種產(chǎn)物，此過程可用下式表示：

　　ES的形成，改變了原來反應(yīng)的途徑，可使底物的活化能大大降低，從而使反應(yīng)加速。

　　三、酶作用高效率的機(jī)理

　　詳細(xì)機(jī)制仍不太清楚，主要有下列四種因素：

　　1.趨近效應(yīng)（approximation）和定向效應(yīng)（oientation）

　　酶可以將它的底物結(jié)合在它的活性部位由于化學(xué)反應(yīng)速度與反應(yīng)物濃度成正比，若在反應(yīng)系統(tǒng)的某一局部區(qū)域，底物濃度增高，則反應(yīng)速度也隨之提高，此外，酶與底物間的靠近具有一定的取向，這樣反應(yīng)物分子才被作用，大大增加了ES復(fù)合物進(jìn)入活化狀態(tài)的機(jī)率。

　　2.張力作用（distortion or strain）

　　底物的結(jié)合可誘導(dǎo)酶分子構(gòu)象發(fā)生變化，比底物大得多的酶分子的三、四級(jí)結(jié)構(gòu)的變化，也可對(duì)底物產(chǎn)生張力作用，使底物扭曲，促進(jìn)ES進(jìn)入活性狀態(tài)。

　　3.酸堿催化作用（acid-base catalysis）

　　酶的活性中心具有某些氨基酸殘基的R基團(tuán)，這些基團(tuán)往往是良好的質(zhì)子供體或受體，在水溶液中這些廣義的酸性基團(tuán)或廣義的堿性基團(tuán)對(duì)許多化學(xué)反應(yīng)是有力的催化劑。

　　4.共價(jià)催化作用（covalent catalysis）

　　某些酶能與底物形成極不穩(wěn)定的、共價(jià)結(jié)合的ES復(fù)合物，這些復(fù)合物比無酶存在時(shí)更容易進(jìn)行化學(xué)反應(yīng)。

　　例如：無酶催化的反應(yīng)　RX+H2O→ROH+Hx 慢

　　有酶存在時(shí)　RX+E桹H→ROH+EX快

　　EX+H2O→E桹H+HX快?